据媒体报道，2009年“分贝网”因涉及色情营运，包括周平在内的多名高管被公安机关调查[18]，有人质疑周小平是否是曾任分贝网副总裁的周平。2013年10月15日，周小平在新浪微博发表长微博回应，承认他就是被搜索到的“周平”，但否认涉及色情活动，并将这次微博称之为“绝笔”。[19]
周小平绰号“周带鱼”，起因是周小平曾在2013年8月26日的博文《谣害天下，无人忏悔》中写道：“薛蛮子为净水器促销，诋毁中国水质有毒，造成舟山带鱼养殖场滞销，当地无数养殖农户面临破产，罪大恶极，谁来追究？”[20][21]然而带鱼属于深海鱼，皆为人工捕捞，目前无人工养殖，因此广大网友在查证后给周小平取了一个“周带鱼”的绰号[22][23][24]。此后周小平始终没有公开认错，并在他的新浪博客中将文字修改为“造成舟山带鱼滞销，当地无数渔民和其他鳗鱼养殖户损失惨重”[25]，并在2014年10月19日的博文中引用改动过的文字辩称：“境外的邪教组织法X功论坛上却把我的话断章取义为‘周小平造谣舟山地区有养殖带鱼’”[26][27][24]。目前，周小平最初发布此文的微博已被删除[28]，但其文集《请不要辜负这个时代》中还保留着原文。新华社在介绍周小平的文章中说明了其绰号的来历，并认为周小平在互联网上还存在较大的争议[22][23]。
周小平的文章风格“独特”，以一度走红于网络的《请不要辜负这个时代》[29]为例，该文用很大的篇幅指责“公知”造谣，但大量读者指出该文有多处伪造史实及数据且充满常识性错误，本身即在扭曲和隐瞒事实，其中一篇《不要姑父的时代》更是指出其44处谣言[30]。这篇文章也在一夜之间引爆了中文互联网上的讨论与激辩[31][32]。该文的同名书籍上市之后，旋即遭到众多网友抵制。部分网民曾在豆瓣图书为该书发起“评一星运动”并使用标签功能对周小平进行讽刺，但豆瓣随后关闭了该书页面的标签和评论显示功能[33]。针对中国互联网上存在部分网民批评周小平的情况，党建网曾发表《讨厌的不是周小平而是你自己》一文，宣称“讨厌周小平其实是个人内心‘敏感多疑’的‘投射’”[34]。
在周小平参加2014年文艺工作座谈会并被习近平点名[1]后，周小平在中国互联网界更是受到了热议。著名科普作家方舟子在读完周小平的作品《梦碎美利坚》后表示：“里面列举的关于美国的种种不是，几乎全是他胡思乱想捏造出来的。他这是梦游美利坚吧？”并撰文逐条列出错误并予以抨击和讽刺[32][35]。其后方舟子在中国大陆的所有博客、微博被封禁，百度、网易等网站出现白名单审查[31]。《钱江晚报》评论员刘雪松也因在该报上发表希望“世界能同时容得下周小平、方舟子”的言论而同样受到所有博客微博被删的处置[36]。同一时间，中国互联网界关于周小平的负面及同官方媒体立场相左的评论及文章大部分也遭到了疯狂删除。对于方舟子被封，党建网发文批评方舟子并称“这事儿没啥不公平”[37]。
对于此事，周小平曾在其微博上发文，称在网络流传的文字是对他长达两万字论述《梦碎美利坚》的“断章取义和曲解拼接”，并称虽然自己遭到了恶毒的攻击，但是“相信中国人更有明辨是非的能力”[38]。其后，周小平贴出了他所称的被断章取义遭到篡改的“原文”[39]。而对于周小平的回应，方舟子在10月25日的博文中称周的文章是从党建网[40]上找到的，不相信党建网会篡改周的原文，而且他引用的部分与周小平在南海出版公司出版的《请不要辜负这个时代》一书中收录的该文的版本基本一致（只有一句有改动）。方称周这次贴出的“原文”只是针对自己的批评所作的粗劣的删改，甚至由于删改手法太“拙劣”还造成了一些语句前后不接。方还表示就算对自己的文章进行了修正，周所贴出的“原文”依然充满了错误。方舟子在文末指周“不愿认错，自己偷改文章再贼喊捉贼”[41]。
2015年1月9日，团中央青网协常务理事周小平赴昆明出席共青团云南省委组织的报告会，有人在会场外打出“欢迎周小平同志莅临昆明传授带鱼养殖技术”的横幅，会议途中有网友向其送上带鱼[42]。
2017年9月10日晚，周小平通过微博发表《周小平：三打猿腾飞！你侮辱志愿军，成藏毒组织导师，辱骂国人都是猪，你还有脸上网？》一文批评袁腾飞。文章称，袁腾飞侮辱中国人民志愿军，并针对袁腾飞就西藏等问题发表的看法进行狠批。事件发生后的次日，袁腾飞的微博突然被关闭[43]。