1942年2月15日马来亚英军司令帕西瓦尔中将向日军山下奉文递交了投降书，新加坡就此沦陷。在日军占领新加坡后，为了报复新加坡和马来亚华人对中国抗战的支持，日军开始了一项早已预谋好的“检证”计划。


山下奉文等人制定的这项“检证”计划以最快的速度传递到了所有日军，要求他们在三天内肃清华侨中的以下人员：
1，曾经在南洋华侨筹赈会中积极活动的人士
2，曾经慷慨地捐赠给筹赈会的有钱人士
3，南洋华侨救国运动领袖陈嘉庚的追随者以及校长，教员和律师
4，海南人
5，凡是在中日战争以后来到马来亚的出生的中国人
6，凡是有纹身的男子
7，凡是以义勇军身份替英军抵抗过日本的
8，公务员以及有亲英倾向的人士
9，凡是拥有武器或可能扰乱治安的人士

山下奉文对日军新加坡警备司令表示：“为了支援其他地区发动新的战役，部队必须马上调用兵力，但新加坡到处都潜伏着敌对日本的华侨，企图阻碍日军的作战。所以，现在必须先发制人的把他们连根铲除，已绝日军的后顾之忧。”日军对于华侨中所谓“敌对分子”明确的指示就是对判定的“敌对分子”，当即处死。
中国抗战以来，新加坡和马来亚的华侨纷纷支持抗战，230万华人每月捐款给国民政府的金额为420万元。抗战最初的5年，华侨捐回国内支持抗战的钱款为50亿元，而1939年国民政府全面的战费则为18亿元。由此可见华侨最中国初期抗战所做的巨大贡献，这也就成为了日军疯狂报复的原因。 6park.com

在日军这场南京大屠杀后，针对华人的另一起大屠杀到底有多少人遇难，这个很难去进行统计了。因为日军在这场大屠杀中选择的地点是在偏避的海岸，只有极少数的人目睹了屠杀的惨剧，而死里逃生着更是寥寥无几。
1945年英国记者认为在这场大屠杀中被杀害的人为5万名，而当时新加坡报纸公布的人数则认定为7万余人。这其中很多华人是全家一起被灭门杀害的。尸体被推到了海中被海水冲走。

新加坡独立后，华侨曾强烈要求日本对这起大屠杀道歉和赔偿，但日本政府拒绝了该项要求，后来新加坡政府多次与日本交涉，日本最后拿出了5000万美元作为赔偿了事，但官方始终拒绝道歉。