阿里提交的招股文件显示，日本软银集团持股797,742,980股，占比34.4%，为最大股东；雅虎持股523,565,416股，占比22.6%；阿里巴巴董事局主席马云持有206,100,673股，占比8.9%，为最大个人股东；阿里巴巴联合创始人蔡崇信持有83,499,896股，占比3.6%。

在软银、雅虎、马云、蔡崇信之外的最大股东是Fengmao Investment Corporation，它持有66,451,613股，占比2.8 %； 
Silver Lake affiliated entities持有阿里巴巴集团58,929,509股普通股，占比2.5%；云峰基金（Yunfeng affiliated entities）共持有34,814,817股，占比1.5%；
中信（CITIC Capital Excel Wisdom Fund, L.P）持有25,806,451股，占比1.1%；Broad Sino Developments Limited持有10,967,742，占比0.5%；Prosperous Wintersweet (BVI) Limited持有10,516,129股，占比0.5%；
Ever Green Growth Limited持有2,258,064股，占比0.1%；Asia Alternatives Management LLC持有1,935,484股，占比0.1%；Pavilion Capital Fund Holdings Pte.Ltd.持有1,935,484股，占比0.1%；Li Ka Shing (加拿大) Foundation持有1,290,323股，占比0.1%。