使用模型检验揭示掌叶大黄复合体的异域分化和种内多样化机制
回答: 物种的时间持久性促进了果实—食果动物互作网络的稳定性 由 董小骚很OK 于 2020-07-27 3:28
山脉隆升、气候扰动、河流重排以及天空岛屿(sky-islands)的限制都可引起物种的异域分化。然而,在上述可引起物种产生异域分化的相关机制中,研究者很难区分到底是哪一种或哪几种机制促使具体的某一个物种产生现今的谱系地理结构。目前已有的研究主要基于物种的群体结构,遗传分化模式和分化时间估计等结果综合推断导致物种产生异域分化的机制,而这些基于结果的推断往往模棱两可且存在很大的主观性。本研究以分布于我国横断山区及邻近区域的掌叶大黄复合体为研究对象,基于简化基因组数据,使用贝叶斯聚类分析、祖先分布区重建,同时结合近似贝叶斯计算比较分析由不同的异域分化机制产生的分化模型,揭示物种的异域分化和种内多样化机制。 6park.com 6park.com正文 6park.com物种的异域分化或种内多样化的机制研究一直是进化生物学领域的研究热点。我国的横断山区及邻近地区一直被认为是生物多样性的热点地区,对分布于该地区物种的进化历史和群体动态的研究认为,山脉隆升、气候扰动、河流重排以及天空岛屿(sky-islands)的限制都可引起物种的异域分化,而山脉隆升和气候扰动被认为是导致物种产生异域分化的主要因素。然而这些研究结论往往都是基于结果的主观推论,如大量的研究主要基于得到的分化时间框架,推测在这一时间框架中发生哪些地质或气候变化事件可能会影响物种的进化历史。由于地质事件和环境变化往往是耦合的,这种基于结果的推断可能会误判影响物种异域分化的因素,不利于准确的解释物种的异域分化和种内多样化产生和维持的机制。 6park.com研究者以分布于我国生物多样性热点地区-横断山区及其邻近地区的大黄复合体为研究对象,利用简化基因组测序技术(SLAF-seq),在大黄复合体的46个居群(图1)共218个个体中得到5256个单核苷酸多态性位点。通过贝叶斯聚类分析、空间变异分析、祖先分布区重建以及基于近似贝叶斯(ABC)理论的群体动态模型框架检验,揭示大黄复合体的种内多样化机制和起源扩散路线。 6park.com 6park.com 6park.com 6park.com 6park.com 6park.com 6park.com结果 6park.com使用简化基因组数据并结合空间多样性分析和群体动态模型验证可成功揭示引起植物异域分化和种内多样化的机制。研究结果表明,大黄复合体存在东部和西部两个种下谱系,而这两个种下谱系还可进一步的进行细分(图2)。大黄复合体的遗传分化中心位于横断山区中部(图3),推测其起源于该地区,尔后向东面和西面扩散形成现今的遗传分布格局(图4)。冰期避难所隔离和随后的二次接触是导致大黄复合体异域分化和种内多样化的主要机制。同时该研究还发现,大黄复合体西部群体中的一个居群具有不稳定的聚类结果是导致该复合体西部群体具有不一致的种内多样化机制的最主要原因(图5)。该研究摈弃了传统的以结果为导向的方法推测和描述影响物种异域分化的因素,为使用以过程为导向的方法研究其他物种的异域分化和种内多样化的形成与维持机制提供了一个全新的视角。此外,该研究还探讨了形态革新(morphological key-innovations)、祖先授粉模式(ancestral pollination systems)、生境异质性(habitat heterogeneity)以及适应性辐射(adaptive radiation)等因素对本研究结果可能存在的影响。
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