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科研圈日报|中国学者构建“女娲”中国人群基因组资源库
送交者: icemessenger[♂☆★★★SuperMod★★★☆♂] 于 2021-11-18 6:10 已读 823 次  

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· 量子计算机与超级计算机 6park.com

IBM 宣布造出全球最大超导量子计算机“鹰” 6park.com

据《新科学家》(New Scientist)11 月 15 日消息,IBM 宣布制造了一台 127 个量子比特的超导量子计算机,其能运行的量子比特数量是谷歌超导量子计算机“悬铃木”(Sycamore,54 个量子比特)和中国科学技术大学超导量子计算机“祖冲之二号”(60 个量子比特)的两倍多。这台迄今为止规模最大的超导量子计算机被命名为 “鹰”(Eagle),但除量子比特数之外的指标并未公布。IBM Q 战略与生态系统副总裁Bob Sutor 称,“鹰“的成功是 IBM 迈向更大量子计算机的垫脚石。IBM 希望能在明年推出 400 个量子比特的处理器,并在后年推出能运行 1000 个量子比特的“神鹰”(Condor)量子计算机。(New Scientist)


日本超级计算机“富岳”连续 4 次居全球超算榜首 6park.com

中新网引用日本放送协会(NHK)11 月 16 日消息,在最新一次全球超级计算机性能排行榜中,置于日本神户市理化学研究所的超级计算机“富岳”在四个性能评比单元连续 4 次位居榜首。全球超算榜单由专家组成的国际会议每半年公布一次。在运算速度单元,“富岳”每秒可完成 1 万亿次的 44 万倍以上的运算,是排名第 2 的美国超算“顶点”(Summit)的大约三倍。除了运算速度之外,富岳还在人工智能的运算性能等3个方面实现四连冠。据悉,“富岳”此前已在 2020 年 6 月、同年 11 月和 2021 年 6 月连续三次排名世界第一。迄今为止,“富岳”已被用于新冠防疫(模拟飞沫传染)和气象预测系统的验证实验(对局部地区大雨进行预测)。《日本经济新闻》报道称,美国和中国分别有计划开发超算后续机型。在美国,有望最早投入运行的是“顶点”的后续机型“前沿”(Frontier),最早可能在 2021 年内投入运行。中国可能会在 2022 年中、下次排行榜发布时推出曾获得世界第一的“神威·太湖之光”和“天河二号”的后续机型。(中新网,日本经济新闻)


· 基因组测序 6park.com

中国学者构建“女娲”中国人群基因组资源库 6park.com



根据中科院生物物理所消息,该机构的徐涛团队与何顺民团队合作构建了"女娲"(NyuWa)中国人群基因组资源库,提供了针对中国人群的遗传变异图谱与参考面板基因型推演服务。 6park.com

这项研究分析了 2999 个中国人的全基因组深度测序数据(26.2X),并以“女娲”命名。基于上述数据资源,研究构建了包含 7106 万单核苷酸多态性(SNPs)和 819 万插入缺失标记(InDels)的中国人群遗传变异图谱,并对其进行全面注释。此外,科研人员构建了包含 5804 个单倍型和 1926 万变异的单倍型参考面板,其中 325 万变异从未包含在其它参考面板中。此次针对中国人群的全基因组测序工作在促进中国和亚洲人群的遗传学研究方面极具价值,并且有助于中国人群的精准医学研究。相关文章 11 月 16 日发表于《细胞报告》(Cell Reports)。(中国科学院)


· 机器学习 6park.com

机器学习准确预测 5400 种哺乳动物传播新冠病毒的能力 6park.com



来自美国卡里生态系统研究所(Cary Institute of Ecosystem Studies)的研究人员开发了一个机器学习模型,预测了 5400 种哺乳动物感染新冠病毒并将其传播给其他动物和人的能力。 6park.com

ACE2 是新冠病毒入侵宿主细胞的关键受体,广泛存在于哺乳动物的细胞内,可被用来预测特定物种传播新冠病毒的能力,但目前仅有 326 个物种的 ACE2 受体对应的基因序列被探明。新研究利用机器学习方法,结合了 5400 种哺乳动物的生物学和生态特性数据和 ACE2 的现有数据,能以 72% 的准确率预测识别具有高传染能力的哺乳动物物种,预测结果能够与观察到的白尾鹿、貂、浣熊、雪豹和其他动物的新冠病毒感染情况相印证。研究发现,排名前 10% 的高危物种跨越 13 个目,灵长类动物在哺乳动物中具有最高的人畜间共患病能力和最强的病毒结合力,水牛在牲畜中风险最高,此外活体交易中常见的哺乳动物猕猴、亚洲黑熊、美洲虎和穿山甲也具有较高的人畜间共患病潜力。相关论文 11 月 17 日发表在《皇家学会学报 B 辑》(Proceedings of the Royal Society B)。(卡里生态系统研究所)


· 海外学界 6park.com

欧洲议会额外拨款超 4 亿欧元,增加地平线欧洲预算并资助学术交流 6park.com

据Science|Business 消息,欧洲议会(European Parliament)在当地时间 11 月 15 日的会议上就 2022 年的预算达成了一项协议,为用于健康、科研和气候行动增加了总额 4.791 亿欧元(约 35.49 亿人民币)的预算。其中 1 亿欧元(约 7.2 亿人民币)用于“地平线欧洲”(Horizon Europe)计划,3500 万欧元(约 2.5 亿人民币)用于学术交流项目 Erasmus+。最终 2022 年地平线欧洲将获得总计 122 亿欧元的资金,以支持欧盟在健康、数字、工业、空间、气候和能源等领域的研究;Erasmus+ 将获得 34 亿欧元;EU4Health 计划将获得 8.397 亿欧元以应对新冠。 6park.com

据悉,尽管预算有所增加,但由于有成员国希望减少支出,最终增幅远低于议会的预期。议会还试图将关于成员国研发支出的非约束性协议标准从占 GDP 的 0.81% 提高至 1.25%。(Science|Business)


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