760扬州穆斯林商人叛乱，百姓驱逐阿拉伯商人。
801穆斯林（阿拉伯和撒马尔罕军队）从南亚方向攻击唐朝，失败，残兵约一万在云南省境内向唐军投降。
1277年，被宋朝任命任为泉州市舶司的回教徒蒲寿庚叛变宋朝，投靠元庭，残杀宋朝皇室及仆从约五千到一万人，抛尸。 
1335元朝皇帝颁布圣旨，规定伊斯兰教必须被称为“清真教”。 1377改信伊斯兰的蒙古—突厥将军枯木儿开始征服中亚、中国西域的战争 
1405帖木儿死，结束了帖木儿为“伊斯兰”而征服中国的一揽子计划。
1513哈密穆斯林叛乱，明失哈密，中国暂时失去对西域的统治权。
1514陕西穆斯林叛乱，穆斯林袭击陕西。
1525西域动乱，西域穆斯林在甘肃省定居。 
1573—1612中国西北穆斯林先后七次叛乱，攻击明朝西域居民及部队。 
1642伊斯兰教徒王岱舆撰写了现存最早的一部汉文伊斯兰教著作；用汉字写伊斯兰教书籍开始。 
1646甘肃穆斯林叛乱，米喇印和丁国栋为首，被平定。 
1648甘肃穆斯林叛乱，清军平定之，其头领斩立决。 
1671未经政府允许，纳合西班底苏非兄弟会渗透到中国西北，私自传教。
1722穆斯林文献开始编制“穆罕默德出现在唐皇的梦中”的谎言，并将此归结为伊斯兰教传入中国的原因。
1755一1762清政府统一准噶尔、南疆。
1761国外穆斯林精心培养的马明心离开也门，渗透到中国，在甘肃传播纳合西班底“新教”（哲赫忍耶）；引发穆斯林“新教”与“旧教”内部冲突，斗争，并引发中国其他地区穆斯林参与内斗。 
1781新教穆斯林暴乱；因穆斯林内斗，危害治安，政府逮捕马明心；武装信徒们试图劫狱救援马明心；马明心被杀，其信徒被镇压。
1783乾隆皇帝下令审查汉文穆斯林经籍；穆斯林采用欺骗手段，宣称清真寺意为“清朝皇帝是真主”的庙宇，收买审查官员，并提供伪经书供审查。后得逞，允许继续著述。 
1784哲赫忍耶穆斯林在田五阿訇带头下，对外宣称为马明心复仇，在甘肃东部展开穆斯林叛乱，被平定。清政府禁止穆斯林教。
1817玛哈图木阿杂木穆斯林在西域首次叛乱，1816年被平定。 
1818云南首次穆斯林叛乱，乱军攻占省城，屠杀汉人，被平定，叛乱首领斩立决。 
1820西域穆斯林叛乱，甘肃穆斯林叛乱，皆被平定。 
1821云南回族穆斯林暴乱，被平定。 
1825—1827西域穆斯林叛乱，被平定。 
1826—1828云南西部回族穆斯林暴乱，被平定。
1834清政府鼓励内地百姓向西域移民。
1839云南穆斯林暴乱，被平定。
1845云南穆斯林暴乱，被平定。西域穆斯林叛乱。
1846云南穆斯林暴乱，被平定。 
1847云南穆斯林暴乱，被平定。 
1855西北回族穆斯林叛乱。轮台维吾尔穆斯林叛乱，甘肃撒拉族穆斯林叛乱。 1855云南穆斯林暴乱，在大理建立穆斯林国。被平定。
1862《古兰经》首次在云南被译成汉文。
1862—1877西北回族穆斯林暴乱。屠杀汉人2000万。哲赫恩耶首领马化龙和陕西十八营穆斯林武装力量是反叛核心。清朝总督左宗堂平定叛乱。
1866—1874喀什噶尔突厥人穆斯林统治者阿古柏在英国、俄国和奥斯曼人支持下入侵西域，建立“穆斯林政权”，于1877年被平定。 
1871自称为“救世主”的穆斯林新教头领马化龙，死。 
1873云南回族穆斯林暴乱，被平定。
1877清军入疆，消灭阿古柏叛乱政权。 
1895甘肃东部穆斯林内乱，内斗，长达18个月。为稳定地方治安，清政府派军平定暴乱。 
1906—1908穆斯林阿訇王浩然在伊斯坦布尔同奥斯曼苏丹阿布都?哈米德二世取得联系，为国外穆斯林进一步渗透中国铺垫道路。
1907苏丹派两名土耳其官员、突厥神学家到北京传教。
1912王浩然创建中国回教俱进会。（该组织性质未经考证） 民国初年，西域宁边城（今西域昌吉）穆斯林屠城。
1928西北回族穆斯林暴乱，马仲英为首，反冯玉祥，持续两年，后被平定。 1931中国的穆斯林到埃及爱资哈尔大学学习；《古兰经》汉译第一次由王静斋阿訇全部完成。
1943哈萨克族穆斯林西域暴乱。
1944维吾尔一哈萨克一乌兹别克族穆斯林西域暴乱，建立伊斯兰教“东土耳其斯坦共和国”。
 中华人民共和国时期（50——70年代） 
1951年，马匪步芳旧部叛乱，被解放军迅速平定，上万名马匪被击毙； 
1958 年青海省循化县发生武装叛乱；
1958年甘肃的广河、东乡等地发生大规模反革命叛乱；
1958年3月至8月，甘、青省内一部分反动的宗教上层分子和部落头人、为了维护其封建统治和本阶级的利益，在帝国主义和西藏反动集团的唆使下，掀起了反革命武装叛乱。先后参加叛乱的有13万余人,叛乱地区达42万平方公里。兰州军区根据中央军委的指示，坚持了以军事打击，政治争取和发动群众相结合的方针；在战术上采取了以集中对集中，以分散对分散，集中与分散相结合的原则；采取由近到远、由东向西、由北向南，先农业区后牧业区的平叛步骤。胜利进行了平叛作战，共歼灭叛匪11.6万余人，收缴各种枪70000余支。 
1962年西域伊犁地区发生大规模骚乱，大量的回鹘，哈族等群众，在苏联克格勃和某族的几个叛将的煽动下，先是冲击各级政府，然后大量逃往苏联，先后三次，数量达60000余人。 
1975年，云南沙甸事件。冲突中穆斯林不让解放军进庄。被镇压。 
中华人民共和国时期（80年代——新世纪） 
1987年，在某出版社出版发行的《中国少数民族婚姻家庭》一书中，由于对有关少数民族婚姻的描述失实，甚至歪曲和侮辱少数民族同胞，引起了部分少数民族的强烈不满——其实就是某教某族，我认为描写是真实的，当然实话比较痛苦。
1988年，由陕西电视台所办的《电视剧》杂志发表了《大将西征》剧作，叙述了清代同治年间陕甘总督左宗棠率兵收复西域的故事。该剧作把领导陕西回民起义的领袖白彦虎描写成“民族叛徒”，引起回族等少数民族群众的不满。经过陕西省委宣传部、省民委等部门的调查处理，使这一影响回汉民族团结的事件得到妥善处理。
1989年3月，上海文化出版社出版的《性风俗》一书，引起某教教徒全国性的散步，示威，抗议，骚乱，暴乱 1991年，海湾战争爆发，云南红河州沙甸等地，某教分子大规模示威散步，要求中国政府出兵援助伊拉克总统萨达姆。
1992年8月—10月，云南文山州平远街“严打”穆斯林贩毒分子。平远镇7个村庄严打80天，抓获惩处854名罪犯，缴获各类***1000多支，搜出毒品1000多公斤，毒资1000多万元。
1992年10月《重庆日报》发表的《“小麦加”临夏》一文，又引起某教教徒全国性的抗议散步； 
1993年5月，《环球》第五期发表《别有滋味伊朗行》，再次引起某教教徒抗议； 
1994年8月，四川美术出版社出版的《脑筋急转弯》一书，立即引起回族群众的不满，引发少数民族聚集事件
1994年，宁夏发生西吉事件，影响波及青海等地，某教折合忍耶教主马烈孙（宁夏政协副主席）,因在教派冲突指使杀人而被判处有期徒刑15年。 
2000年某晚报刊登的题为《吃肉的是是非非》一文发表后，导致穆斯林不满示威； 
2000年夏，浙江电视台播放的电视连续剧《张文祥刺马》中，出现了在清朝道光年间任两江总督的山东荷泽回族马新贻的家族祭祖和祭祀时，在供桌上供有猪头的镜头，引起回族的不满示威。
2000年12月8日，山东省阳信事件。12月12日，在少数人的串联、组织下，河北省孟村回族自治县数百名回族群众乘车前往阳信县，在阳信县境内与劝阻民警发生冲突。由于当地少数干部处理不当，造成6名群众在冲突中死，19人受伤，13名民警受伤。
2003年1月12日，天津《今晚报》刊载署名文章“人性寓言”，严重亵渎了伊斯兰，引起天津穆斯林示威 2004年，河南中牟事件，回汉大规模的冲突； 
2005年，河南封丘事件，回汉大规模的冲突；
2005年6月，山东淄博市山东理工大学事件，汉维学生大规模冲突； 
2005年10月，中央电视台“黄金搭档杯”模特大赛，使用某教的宣礼声被抗议事件。
2006年2月，河南新郑华阳寨事件，回汉大规模的冲突；
2006年6月17日，歌手许巍在唱歌前奏中加入了一段诵经的采样 被封杀。 
2009年7月5日，轮台大规模打砸抢事件。