| 送交者: 苦难与荣耀[☆★★声望品衔12★★☆] 于 2020-06-11 0:47 已读 1592 次 2 赞 | 苦难与荣耀的个人频道 |
昨天，在本版发了一篇回应帖“对版神再度评论帖的答复” https://club.6parkbbs.com/life2/index.php?app=forum&act=threadview&tid=15471389 6park.com帖子发出，人潮人海的生活百态众网友不约而同，纷纷礼让七分，绕道而行，让人受宠若惊。 6park.com刚才上来，总算在帖子下捡到块砖头，上面赫然写着“苦难与荣耀的文章只不过是非专业人士的牵强附会” https://club.6parkbbs.com/life2/index.php?app=forum&act=threadview&tid=15472020 6park.com感谢hulizhi网友赐砖！一个帖子下面，连块砖头都没有，那能叫帖子？那是官家的告示，或者商家的广告。 6park.com“灵感源自碰撞”，“真知出于辩论”。发帖，就要敢于直面无情的砖头，真相，离不开砸出的鲜血。意见交锋可喜，遭逢唯恐无沙埋头的鸵鸟可悲。“hulizhi”网友的果敢、自信、爱憎分明令人肃然起敬，得他授予“非专业人士”称号，深感荣幸，我的头衔又多了一个，可喜可贺。 6park.com转入正题。在应答“hulizhi”网友的评论内容之前，有必要先做一些简要说明，以便各位网友了解相关背景。 6park.com下图右侧，示意了冠状病毒的蛋白序列结构，及病毒体构造。 6park.com6park.com图中冠状病毒外部的红色突起，叫做S蛋白，或Spike蛋白，刺突蛋白，棘突蛋白。S蛋白是冠状病毒与宿主细胞受体结合，进而感染宿主细胞的钥匙。 6park.comS蛋白由两部分组成，一部分是S1蛋白，位于S蛋白的外部，另一部分是S2蛋白，位于S蛋白的下部，和病毒的包膜连在一起。如果把S蛋白看成是打开宿主细胞（如人体细胞）的钥匙，那么，S1蛋白相当于钥匙的“钥齿”部分，S2蛋白则相当于钥柄部分。 6park.com关于SARS-CoV-2（新冠）病毒的来源，有两种观点，一种认为它是自然变异产生的，另一种则认为它是在实验室人工干预下产生的。 6park.com如果SARS-CoV-2是自然变异产生的，那么，它是由哪种病毒演化而来的呢？研究发现，与SARS-CoV-2存在时间进化关系的已知病毒中，亲缘关系最近的，是一种叫做CoVZC45的类SARS冠状病毒。这一病毒提取自2017年从舟山捕获的蝙蝠，所以通常也称作舟山蝙蝠病毒，它的全基因组序列已于2018年上传至国际基因库全球共享。舟山蝙蝠病毒其实有两株，另一株是2015年得到的CoVZXC21，它与SARS-CoV-2相似度87.3。 6park.com一方面，CoVZC45与SARS-CoV-2基因相似度为87.5，另一方面，二者也有多处明显区别，其中的两个是： a) CoVZC45的S1蛋白不能与人体细胞受体ACE2（血管紧张素转换酶II）结合，从而无法感染人。众所周知，SARS-CoV-2则有强大的人际感染、传播能力。 b) CoVZC45没有酶切位点，而SARS-CoV-2则有酶切位点。 6park.comSARS-CoV-2的酶切位点恰恰位于S蛋白的两个亚基S1蛋白、S2蛋白的交界处，见下图。这个位置的酶切位点给SARS-CoV-2带来了不只一个极为强悍，极为可怕的功能。 6park.com 6park.comCoVZC45没有酶切位点，但只要在CoVZC45蛋白序列的S1、S2交界处，插入四个氨基酸（残基，对应4*3=12个碱基对）“PRRA”，其中的“RRA”，与原序列中紧邻的“R”，就构成了SARS-CoV-2的furin酶切位点“RRAR”。参见下图，图中第二行是SARS-CoV-2的氨基酸序列（或叫蛋白序列），第四行是CoVZC45的氨基酸序列。 6park.com 6park.com下面这个图可以看得更清楚一些。 6park.com 6park.com现在，各位网友对基本情况应该已有所了解，下面，我开始答复hulizhu网友的评论。加黑内容来自评论。 6park.com首先，请问hulizhu网友，既然您火眼金睛，看出我是“非专业人士”，那么，比我专业的您，应该知道下述问题的答案：酶切位点是什么？含几个碱基对？几个氨基酸？长度长不长？是大片断还是小片断？ 6park.com这些问题，在下述的讨论中将要涉及到，它们的答案，在我前面的交待中其实已经讲到了。 6park.com“大片段变异（如基因重组等）绝非可以忽略的误差！” 6park.com请问，“大片断变异”怎么把大片断序列塞到S1/S2位置上产生小片断的酶切位点？能否描述一下可能的实现过程？难道先用大片断序列把CoVZC45的S蛋白吃撑，再拉出一大部分，恰好剩下了那一小截？这种情况机率有多大？忽略它造成的估算偏差能有多大？ 6park.com“事实上，病毒不仅可以通过基因重组获得突变，甚至可以从宿主基因组中获取基因片段！” 6park.comCoVZC45可在哪些情况下，与哪些生物通过基因重组获得酶切位点突变？它可以从哪些宿主的基因组中获取酶切位点片断？这两种途径的可能性有多大？如果可能性很大，为何CoVZC45所在的β谱系的冠状病毒，绝大多数都未能获得酶切位点？这几个问题您的答案是什么？ 6park.com“恰恰相反，自然界中各生物体的基因组序列差异不可能‘大致均匀分布’。” 6park.com您的这个说法跑题了，应修正为“恰恰相反，自然进化情况下，祖先（CoVZC45）与后代（SARS-CoV-2）之间基因序列上的差异不可能‘大致均匀地分布’”。 6park.com因为，您是在辩驳我的观点，我的原话是“自然进化情况下，祖先（CoVZC45）与后代（SARS-CoV-2）之间基因序列上的差异应该大致均匀地分布”。 6park.com或者说，我们讨论的是，‘自然进化情况下祖先与后代之间的基因序列差异’，而非“自然界中各生物体的基因组序列差异”，这是两个天差地远的问题。讨论应该针对彼此的观点有的放矢，不该转移话题，但我相信您是无心之失，不是有意移花接木，偷梁换柱。 6park.com“b. 自然进化情况下，祖先（CoVZC45）与后代（SARS-CoV-2）之间基因序列上的差异应该大致均匀地分布，相对协调地产生，不应该出现仅某个部分大量变异，而其余部分都高度稳定的情况。其他所有蛋白的一致性都>=94%，唯独S1蛋白的一致性仅为69%，如此突兀的“自然变异”，在自然界很难找到先例。 ” 恰恰相反，自然界中各生物体的基因组序列差异不可能“大致均匀分布” 6park.com上面最后一句是您的评论（前面刚刚提到过了），之前b.之后的内容来自我的“实验室合成、编辑SARS-CoV-2简明教程”一文。 https://club.6parkbbs.com/other/index.php?app=forum&act=threadview&tid=12996959 6park.com如果您反对我所说的 “不应该出现仅某个部分大量变异，而其余部分都高度稳定的情况。其他所有蛋白的一致性都>=94%，唯独S1蛋白的一致性仅为69%，如此突兀的“自然变异”，在自然界很难找到先例。” 6park.com这一说法，那么，您是否能举出三个情况相似的进化例子？您即便只能举出一个例子，我也认可。 6park.com同时，我还希望您解释一下，CoVZC45（祖先）与SARS-CoV-2（后代）的各蛋白中，为何独独S1蛋白发生了那么大面积的变异？什么样的自然环境或自然情况，能促成这么不均衡的变异？ 6park.com“楼主明显不知道在生物体基因组中存在高保守区域（highly conservative region)。在这些区域中突变很少发生。而在另一些区域，如流感病毒的H和N基因位置的突变率则会非常高。” 6park.com我有点困惑了，您是学东西一瓶子不满，半瓶子晃荡，不懂装懂？还是瞒天过海，故意含混糊弄人？ 6park.com“其他所有蛋白的一致性都>=94%，唯独S1蛋白的一致性仅为69%”这个事实，您居然能用高度保守序列来解释？真是服了You。高度保守序列在全部基因组序列中所占的比例可能有这么大吗？！除了S1蛋白，舟山蝙蝠病毒CoVZC45其它所有蛋白序列都大比例变成高度保守序列了？您这个重大发现，发表了吗？ 6park.com 6park.com“专业”与否，是看印制的名骗，还是看所做的事情？ 6park.com开个玩笑，hulizhu网友，您的专业名片掉色了，重印十盒新的吧。 6park.com 6park.com 6park.com贴主:苦难与荣耀于2020_06_11 0:49:44编辑 6park.com贴主:苦难与荣耀于2020_06_11 1:10:41编辑 6park.com贴主:苦难与荣耀于2020_06_11 2:11:01编辑 6park.com贴主:苦难与荣耀于2020_06_11 2:34:12编辑 6park.com贴主:苦难与荣耀于2020_06_11 6:38:34编辑
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