1999年，菲律宾趁火打劫，在中国驻南联盟使馆遭美国轰炸的第二天，菲律宾从本土派出一艘破旧的坦克登陆舰“57”号舰驶往仁爱礁，前身是美国二战期间的542级坦克登陆舰，1944年服役，舰长100米。它于1976年转交给菲律宾，可以说这艘军舰已经十分老朽。

当登陆舰到达仁爱礁附近后，并没有进行常规的减速停靠操作，反而开足马力撞上了仁爱礁，然后菲律宾立刻对外谎称“船底漏水，不得已‘坐滩’”。菲方并以此为据点，赖着不走，并派出士兵轮班进驻。
菲律宾坐滩仁爱礁23年，如今中国虽然已经实控仁爱礁，但是这艘破船还是搁浅在礁盘上，毕竟这属于军舰，防止矛盾激化，所以中国并没有驱离船上人员。
而在仁爱礁之后，菲律宾曾经多次故技重施，2016年3月，菲律宾派遣老旧的运输船再次故意在五方礁“搁浅”。五方礁是由五方尾、五方南、五方西、五方北和五方头共五个较大岛礁组成的不封闭环礁，礁体平均直径为10.5公里，礁盘面积约有80平方公里，潟湖面积有69.3平方公里，干出礁（低潮时露出海面）面积达6.3平方公里。五方礁与菲律宾非法侵占的马欢岛和费信岛临近，菲律宾一直想侵占五方礁和马欢岛和费信岛连成一片，弥补两岛礁盘太小的缺陷。
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按照菲律宾方面的说法，称一艘来自马尼拉的运输船在五方礁“由于天气”搁浅。然后菲律宾叫来了许多的渔民来此打渔，想要坐滩五方礁。
当时中国已经在美济礁填海造陆完毕，对南海的监测能力大大提高，菲律宾运输船一搁浅，多艘中国船只就前来巡逻，巡航的舰船包括4艘军舰和1艘海警船，不允许菲渔民靠近，这些船原本就在美济岛附近，得以快速赶到现场，并且“封锁”了该水域。并对菲律宾方面召来的菲律宾渔民进行了“劝离”。

菲律宾非常生气，强调那一带是菲渔民的“传统捕鱼水域”，但因中国船只阻拦，菲渔民现已不能前往作业，好像他们受了中国欺负一样。
菲律宾DZMM广播电台在报道此事时说，中国已经实际控制了五方礁，北京在南海的行为愈来愈武断，“连美国都不放在眼里”。
但是中国完全无视菲律宾的抗议，最后搁浅的运输船也被迅速拖带出浅海，妥善处置。
2018年，菲律宾更是想要坐滩半月礁，半月礁位于司令礁东北约110公里，距离仁爱礁大约100公里，环礁不完整，呈半月形。礁长5.5公里，宽约2公里。低潮露出，东南有一宽敞的礁门，300吨级的船只可进入礁湖，沙质底，平均水深27米，口门水深12.8米，湖底为珊瑚沙。半月礁渔业资源丰富，且有好的锚地和天然避风港湾，是琼海渔民在南沙海域作业的传统渔场之一，渔民常到此捕捞。半月礁是中国南沙群岛岛礁之一，是中国固有领土。

在中国南海有9条断续线组成的U形线，通常称为九段线，该线是南海诸岛归属范围线。
中国对南海主张的基础是九段线( U 型线) 。 自1948年国民政府首次在《中华民国行政区域图》 中标绘出十一段断续线后 ‚直至新中国成立后出版的各种地图上 ‚都继续标出这条断续线(1953年去掉北部湾内两条而改为九段线) 。 1992年中国通过的《 中华人民共和 国领海及毗连区法》‚再次将此疆域范围予以正式化。我国政府对南海问题的一贯立场就是“ 中国对 南沙群岛及其附近海域具有无可争辩的主权”。

九段线在地图上可以轻易地标绘出来，但对于在海上的舰船想要识别就比较困难了，由于没有准确坐标，即使安装了北斗导航也很难分辨是不是驶出了中国领海。
而黄岩岛和半月礁都是这样的岛礁，都位于九段线附近，中国实际控制并建设后，中外渔民都很容易明确，离这些岛礁或岛礁的延长线多远就进入了中国的领海，北段黄岩岛，南段半月礁基本就框定了南沙群岛以东的国界线。
可以说，半月礁起到了中国海上界碑的作用。2018年，一艘菲律宾海军的护卫舰搁浅在南海的半月礁附近，菲律宾表示目前正在努力解决搁浅问题并营救受困的船员。而菲律宾方面的表述是在哈萨哈萨礁附近搁浅，这是菲律宾对半月礁的称呼，正如日本管咱们的钓鱼岛叫尖阁列岛一样，言下之意非常明显。

德尔皮拉尔”号(FF-15)巡逻舰，原是美国海岸警卫队的海警船，于2011年5月卖给了菲律宾，从而成为菲律宾海军最大的舰船。虽然这艘所谓的军舰有着53年的舰龄，但因为其3390吨的排水量，远远超过菲律宾海军那些大都不足1000吨的军舰，所以成为了菲律宾海军的旗舰。
而面对菲律宾提出的正在想办法救援，中国公开表示：如果菲律宾的船只确系不慎搁浅，菲方可以派船将其拖离，如果菲律宾方面有需要，我们也可以发扬精神进行帮忙。
换句话说，也就是：“要么你们自己拖出来，要么我们帮你拖出来。”
从半月礁这次事件，国际上发现，中国应对南海海上突发事件的经验不断积累。此次搁浅事件发生后，中国很快集结了多艘护卫舰和海警船前往查看并派船值守，调派驻守在渚碧礁的救援船前往并表达协助意愿，在菲舰脱浅后立即勘察评估半月礁的环保损害情况，同时中菲之间的外交沟通渠道畅通有效，体现了中国拥有对南海突发事件的快速反应能力和系统化、多部门协作的应对措施，南海岛礁建设与涉海部门机构调整卓有成效。

而在中国提出要用搜救船拉走战舰之后，仅仅过了4天，菲律宾就自己用拖船将“德尔皮拉尔”号巡逻舰从半月礁浅滩拖走。自此之后，菲律宾再也没有在南海闹事过。
可以说，随着中国在2015年南海填海造陆，将美济礁、渚碧礁、永暑礁打造成了不沉的航母之后，中国对南海的实际控制力大大增强，南海有任何举动，中国都尽收眼底，并且美济礁、渚碧礁、永暑礁互为支援，有力捍卫了中国在南海主权。
随着中国的国际实力不断增强，菲律宾也意识到和中国只有合作才是长久之道，菲律宾强调南海争议不是双边关系的全部，同意妥善管控分歧，以和平方式处理争议。这基本是确认，被美国一直炒作的南海争端，宣告了破产。