超过70所接受中共政府资助的美国大学和学术机构没有向教育部披露这些捐赠，美国国会议员和教育监督者对中共渗透美国大学表示担忧。另一方面，美国反对孔子学院的呼声和行动也越来越多。
美国教育部要求所有获得认证的大学披露从外国获得超过25万美元的捐赠信息。但是，根据《华盛顿自由灯塔》6月15日刊登的一篇调查报导，在与中共孔子学院有联系的美国大学和学术机构中，只有30%的学院申报表明接受了北京的捐赠。
《华盛顿自由灯塔》联系了75家未向联邦政府报告外国资金的高等教育机构，只有22所机构做出回应。多数机构表示，由于捐赠低于25万美元门槛，所以没有透露捐款。
全国学者协会（National Association of Scholars）政策主任拉切尔·彼得森（Rachelle Peterson）表示，缺乏问责制是“警报”，25万美元限额的门槛“太高”。
她说，在大学或学院里，尤其是传统上资金较少的人文学科机构，很少的钱就可能会产生很大影响。
中共向美大学注资 在美国审查言论
中共政府已向美国大学捐赠大量金钱，以支持全国一百多个孔子学院，捐赠者包括一些知名中国企业。
美国参议院国土安全和政府事务委员会去年发布报告指出，中共在这个所谓的教育机构“孔子学院”上已花费了近2亿美元。孔子学院的存在是中共长远战略的一部分。
《华盛顿自由灯塔》报导，密歇根大学、马里兰大学和亚特兰大的埃默里大学在2014年至2020年期间共获得3040万美元。该媒体所联系的其它几所着名大学，例如哥伦比亚大学、斯坦福大学和芝加哥大学，都没有回应。
长期以来，美国国会和高等教育监督机构一直表示，孔子学院是北京的一种重要渠道，用来推动共产党宣传，并传播对中共政府有利的中国历史。
参议院报告说：中共通过一系列课程和资金计划几乎渗透到美国教育系统的每一个部门，这些计划将中共的宣传带进美国课堂，旨在对美国的孩子进行灌输。
参议院和联邦调查还发现，中国教师与中共政府签订合同，承诺不会损害中国（中共）的国家利益。这些限制试图输出中共对政治言论的审查，阻止人们讨论潜在的政治敏感话题。
传统基金会高级研究员迈克·冈萨雷斯（Mike Gonzalez）对《华盛顿自由灯塔》说：“中国共产党不需要征得被统治者的同意。” 他表示，中共非常习惯在中国审查言论，它们想通过不同方式在美国做同样的事情，孔子学院是其中一种方式。
美国开始拒绝孔子学院
随着美国各界对中共渗透和孔子学院的了解加深，反对孔子学院的呼声也增加。今年5月，美国民主、共和两党下属的学生组织的领导人近日联名签署公开信，呼吁关闭所有在美国的孔子学院，并抵制中国共产党对美国大学的影响。
这封由非赢利组织“雅典学会”（Athenai Institute）在5月13日发表的公开信说，中国共产党通过在美国高校设立孔子学院等方式，“公然试图在美国和世界各地的大学中胁迫和控制言论，这对学术自由构成了生死存亡的威胁”。公开信呼吁立即永久关闭在美国的所有孔子学院。
这封名为“华盛顿呼吁”（Washington Appeal）的公开信获得了两党学生组织领袖们的支持。
“华盛顿呼吁”的另一位主要发起人、刚刚毕业的大学生迦勒·麦克斯（Caleb Max）强调说，反对孔子学院不是反对中国人民，孔子学院的问题在于它是由中国共产党出资设立的。
孔子学院对美国校园影响力近年来也开始下降，目前孔子学院在美国运营81个课程，而2017年为103个。