台湾海巡署2月14日表示，当日下午1点45分在金门北碇，禁止水域线内0.5浬巡逻时，发现一艘中国籍快艇越界，立即执行驱离作业，但因该快艇高速蛇形躲避动作拒检，追缉过程中四名中国船员不慎落海，海巡人员立即搜救，其中两人生还，另两人紧急送医抢救后不治。中方提出强烈谴责之后，又限制公众舆论，试图对事件降温。专家分析，中共害怕民间矛头反指，导致事情失控。
中共国台办发言人朱凤莲在一份声明中称，对中国新年期间发生这样一起严重伤害两岸同胞感情的恶性事件向台方表达“强烈谴责”。新华社报道，福建一艘渔船在金门海域被台方驱离，导致船上4人全部落海，国台办发言人朱凤莲表示，台湾当局“以各种借口强力查扣大陆渔船，以粗暴和危险的方式对待大陆渔民，这是导致这起恶性事件发生的主要原因”。


2月18日，台湾海委会主委管碧玲指出，近2个月金门民众报案中国越界捕鱼达24案，海巡署人员执法有必要，不是恶行。这次事件将接受检察机关侦办，台湾司法会还原真相，至于2名生还者会受到应有照顾，随着案件进度，很快可以遣返。

管碧玲强调，死者为大，除了人道抚慰，台湾风险保障制度成熟健全，政府对亡者有第三人责任险保障；台湾重视人权，家属抵达后，相关权益保障都会协助。 6park.com
台湾军事专家、国家政策研究基金会副研究员李正修对记者表示：“中共多年来放纵福建、浙江渔民，不定时闯入金门、马祖的禁止水域或限制水域，刻意挑衅。” 李正修说：“从国台办的发言当中，感觉他们只是定调为驱离事件，驱离过程造成的一个意外事件，他们希望定调成这样，而不想要再节外生枝。”
针对国台办要求台湾负全责。李正修认为：“非常不恰当。你放纵自己的渔民，越界捕鱼，当然是你的错，因为你没有警告，提醒渔民，不得越过两岸之间的划分界线。”
“如果你认为越界捕鱼没有犯错，那是否代表着其它国家的公民在大陆境内犯罪，也不用受你的法律约束？”他质疑。 6park.com
此次事件导致两人死亡，相关评论曾冲上微博热搜榜，但很快一些热门评论区被禁止评论或开启精选评论，民众表达意见受阻，相关话题也被撤出热搜榜，显示中共当局试图对事件降温。

李正修认为：“大陆方面也不希望这么单纯的事情失控，如果让人民的对抗情绪持续高涨，反有可能无法收拾。这种民族主义的激情，一再被激发起来，达到一个高点时，老百姓反而会把矛头指向北京、指向中共，会认为你软弱无能。”
他表示，民族主义是双刃剑，不怕其它国家围堵打压，巩固自己的独裁政权，相当好用，但使用不当，反惹火上身。此次事件爆发后两天，中共看到微博上的激情，甚至说收复台湾就打等等，这样的情绪性留言，可能让它警觉不能再放任下去，以免失控，所以才赶快把这样的留言，或新闻撤下。
“我相信他们应该是警觉到了，不能让这样单纯的小事件酿成意外，反让后面事态发展更无法收拾。”李正修说。
台湾军事专家亓乐义也有类似看法，他对记者表示：“中共觉得这样做可能对它不利，它本来就没有道理，越界了嘛，那海巡单位驱逐它，绝对是有法规依据的。”
“我相信他们也是想要踩刹车，不想让这个事情上身，因为最近出了很多事，像英国的弹钢琴的事件，让全世界都觉得中共很无理，一大堆这样的事。” 他说：“我相信最近整个世界反共的氛围越来越浓，所以它大概会觉得这样搞下去又多出一件麻烦事。”