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科普一波基因编辑,这个能看懂
送交者: droobook[★★基因学砖家★★] 于 2018-11-30 10:15 已读 4167 次 8 赞  

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1.	写作本文目的是,看了太多文章,以科普的名义,“有科没普”或“有普没科”。看了觉得高深,其实不讲人话或散播恐惧。 6park.com

2. 基础知识。 6park.com

a. 人个体是由细胞组成,大概估计37.2万亿(trillion)个细胞 6park.com

b. 每个细胞的DNA,或者基因组,都是一个受精卵复制来的,所以都一样。所以无论是测你的头发,血液,棉棒从嘴里刮下的皮,本质相同。(精子,卵子例外。癌细胞突变很多,也可以说例外。还有其他例外,别杠,否则你就跟我一样成生物狗了。) 6park.com

c. DNA的编码只有四个字母AGCT。生命的本质是信息。我不知道需要多少0和1能编码一个操作系统,但我知道大概30亿AGCT(3 billion)编码人。 6park.com

d. 人类基因组计划(2002年完成),就是把整个30亿AGCT的顺序测出来。 6park.com

e. 现在计算机,一个字节(byte)能存一个字母(A/G/C/G)。所以整个你的编码存计算机上,大概3G。有的电影文件比这大得多。CS的童鞋可能说,这么存,没效率啊!这样想的都是好同学,说的对,请帮生物狗开发出来。 6park.com

3. 什么是编辑? 6park.com

a. 在生活中什么是编辑?我把文章写好,发给老板,boss左删右添的过程,就是编辑(editing)。 6park.com

b. 所以你有一个原始文件,后来改了几个字符,就是编辑。 6park.com

c. 现在说你的基因组(genome),把这个文件打开,或删(deletion),或添(insertion),或涂改(substitution),或打乱顺序(rearrangement)都是基因编辑。 6park.com

d. genome editing严格来翻译是基因组编辑。但大多数时候跟基因编辑不做区别。 6park.com

e. 明白了吗?任何对原始编码文件的改变,都是编辑!! 6park.com

4. 修改电脑文件很简单,在细胞里修改基因组怎么搞? 6park.com

a. 首先你要知道修改哪里,3G的文件,有的地方改一个字母就能杀人(根本长不成胚胎就流产,或者严重遗传病)。有的地方(可能>95%的地方),你整段整段删,毛事没有。 6park.com

b. 3G依然很大,你不可能一个字母一个字母找。所以在电脑上可以用“关键词”搜索,找到地方,再仔细改。 6park.com

c. 在细胞里,最流行的方法当然是CRISPR-Cas9,为什么呢?因为CRISPR-Cas9提供关键词搜索功能。你给Cas9加上“关键词”guide RNA,然后放一堆的Cas9到细胞里,她们随机碰撞,找到基因组里看对眼的(match)的“关键词”就切一刀。问题是细胞好好的DNA,被这么切一刀,当然不乐意。然后就会派“有关部门”来修补,不过跟我们熟知的TG有关部门一样,干活邋遢。修补后基本跟原来不一样,所以就“编辑”了。 (关于Cas9简单解释,以后有时间专门详细科普) 6park.com

d. 是不是很粗放?听起来很不靠谱?这么想就对了。您别嫌弃,这就是人类生命科学皇冠上的明珠技术。诺奖只是时间问题的CRISPR-Cas9。 6park.com

5. 听起来这么不完美的技术,用起来当然要小心谨慎。在实验室搞科研都要多方思量,在人身上更不能冒失了。 6park.com

a. 要创造一个基因编辑的哺乳动物,需要从受精卵做起。为什么?答案是反问句:你是改一个文件,然后复制37.2万亿次,还是复制37.2万亿次,再一个个修改? 6park.com

b. 脱靶问题,似是而非的“关键词”。Cas9的一大特性是“promiscuous”,不知道为什么英语生物学家喜欢用这个单词。就是“滥交,淫荡,见汉子就上床的意思”。不过形容Cas9很准确。很多时候,你给Cas9提供关键词,她会用,但见到跟“关键词”相似的,一样用。这个就是所谓的“脱靶”。具体“擦枪走火”到哪,这个查找难度基本等同查找“谁是老王?”。为什么贺建奎干的事技术层面太冒失?记得人基因组多大?3G呢,其中任何一个字母都可能是“隔壁老王”。单个脱靶的几率很小,但乘于30亿,就很大了。 6park.com

c. 这么邋遢,怎么保证修改后是你想要的?这个问题在实验室能实现, 把不是想要的细胞全干掉就行了。小鼠也一样,不合适杀掉就是。直到找到合适的。科研嘛,一阵操作猛如虎,最后找到一个就行。 6park.com

d. 但。。。对人不能这么干!唉,其实,天地不仁,领袖们也不仁,地球就一大培养皿,人类就这么适应了。不适应你去死啊?!想这个太累,不如努力交配。 6park.com

6. 嵌合性(mosaicism)问题。这是一个高级概念,有点点难度。看不懂就跳过。怎么形成的呢?Cas9被注入第一个受精卵,然后受精卵分裂成两个。如果分裂后cas9才编辑,那么很大可能两个细胞最后是不一样的。最后两个不一样的细胞长成一个个体,可能头是一种基因,脚是另一种。如果这种事不是在两个细胞阶段发生,在4细胞,16细胞呢?再考虑脱靶因素,个体就要由各种“花式”基因的不同细胞组成。这就是嵌合性(mosaicism)。结果就特复杂,风险更不可预测。 6park.com

7. 最后,人的基因是成对的。基因编辑需要两个都编辑。贺建奎编辑的双胞胎,其中一个婴儿的CCR5基因只编辑了一对中的一个。CCR5基因的功能,一个的作用跟一对不差太多。所以,纯技术上说,他想要的目的也没达成。对一个宣称谨慎的人,挺失败的。

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